有一天，米奇家莫明其妙地发生了一件突发案件——米奇的朋友米妮被人绑架了。米奇立刻打电话给名侦探柯南，柯南联系了黑猫警长，一起来到了案发现场调查。

名侦探柯南和黑猫警长一来到案发现场，只见米奇正坐在地上哭哭啼啼，在门口还有两行神秘的脚印。黑猫警长问米奇：“这一天都有谁来过你家？”米奇忍住悲愤回忆了下，认真地回答道：“早上，米妮到我家来玩。接着，唐老鸭、斑点狗和牛大伯也来到了我家拜访，然后就回去了。我和米妮一直玩到晚上，突然，不知是停电还是被人切断了电源，家里的灯都熄灭了，我刚要去点蜡烛，就在这时，门突然被打开，我吓得赶紧躲到了沙发的后面，米妮却吓傻了，呆在原地一动也不动。接着，一个黑色人影走了进来，他长得又高又胖 …… 最后就把米妮给绑走了。”说完，米奇又哭了起来?？履咸旰?，找起了蛛丝马迹，黑猫警长拿出通话器，命令白猫干警立即挑选出优秀的白猫队员来到现场，准备作战。

名侦探柯南找了一会儿，除了那些可疑的脚印，没有发现任何可疑的东西?？履狭⒖棠贸錾衿姹Ρ辞?，召唤出妙蛙种子和菊草叶，让它们在房子的每个地方闻一闻，有没有可疑的气味，又召唤出喷火龙和鸭嘴火龙，让它们往上方喷出小火，为房子照明。这时，白猫部队赶到了，黑猫警长命令白猫队员们立刻在房子外围找一找有什么可疑的东西和可疑的人。

过了一会儿，白猫部队虽然没有找到什么可疑的东西，但是他带来了三位嫌疑人，他们就是米奇的邻居唐老鸭、斑点狗和牛大伯，经过仔细的调查和审问，他们三个都不是凶手，那谁才是真正的凶手呢？

正在大家一筹莫展的时候，黑猫警长想到了一个好主意，立即打电话到“快乐星球”，接电话的是艾克，黑猫警长连忙请艾克把他的“万能手表”带来用一下。

不一会儿，艾克也来到了案发现场，把“万能手表”对准可疑脚印按了追踪系统，“万能手表”在一瞬间变成了“电子警犬”，照着凶手留下的气味一路追踪了过去，大家都随着警犬一齐前进。不一会儿，他们来到了一个小屋外，黑猫警长命令白猫队员立刻包围这间小屋，进行地毯式搜索。

过了不久，白猫队员带出来了两个人，一个是米妮，另一个就是那个神秘人了，他又高又胖，和米奇所形容的一模一样。米奇一见到了米妮便激动地拥抱了上去，他心里的一块大石头终于落地了。

经过严厉地审问，知道了那个绑架米妮的人就是三年前无恶不作的黑狗集团中的老大，他原来是想绑架米妮来控制米妮当科学家的父母，为他们制造武器。经过大家的努力，黑狗集团的所有人都被抓住了，也破灭了他们的大阴谋。

为了庆祝这次胜利，米奇邀请了名侦探柯南、黑猫警长和艾克等人来到米奇妙妙屋去作客。大家都沉浸在欢乐的气氛中。